首度基因徐健:基因产业的现状和未来
原标题:首度基因徐健:基因产业的现状和未来
徐健。美国佛罗里达大学博士、美国加州大学博士后研究员。首度基因集团创始人、总裁。早年从事维生素D诱导基因表达及光调控基因的表达谱的研究,发表SCI文章数十篇,并获得过1997年法国:“维生素D国际研讨会”的青年研究家奖。是具有20多年的核酸 (DNA analysis) 测试和管理经验,专门负责产品和市场开发高效科学家。
首度基因(首度生物科技(苏州)有限公司)坐落于苏州工业园区,以癌症基因检测为起点,致力于癌症的预防、诊断和改善治疗。是一家集生命科学与基因大数据分析为一体的公司。
【基因产业背景】
人类基因组计划对人类社会的发展极具意义,80年代起美国作为主导,联合英国、中国、日本等其他国家共同开展了基因测序计划,花费共计30亿美元测了一个人的完整基因组,可以在绘制人类基因蓝图上获得了巨大成功。但是人类的疾病问题并未迎刃而解,因为仅仅是基因测序,后续的精准医疗和精准预防服务还需要时间,在此之前,还必须解决人类基因测序成本昂贵的问题。
在2000年至2015年间,随着基因二代测序技术的发展和完善,测序一个人的全基因组成本降至1000美金,时间也缩短到几天。相信在下一个15年,每个人生命基因蓝图,能和精准医疗和精准预防深度结合,为人类的健康和长寿创造更多机会。
图1:人类基因组计划的三个阶段
【基因产业市场概况】
根据BBC research的报道,2007年2018年,基因测序的市场规模,保持了快速的增长。
图2:基因测序市场规模增长图
从基因测序技术的主要技术分类来说,即时定量PCR技术和二代测序技术发展的比较快。
图3:主要测序技术的市场容量图
图4:主要测序技术的市场增量图
从产业链角度,基因产业链分为上游、中游和下游,上游是基因测序仪器设备供应商和试剂供应商,利润最高。全球知名厂商主要是国外公司,中国也有一些厂商通过购买国外公司,陆续掌握了二代测序仪的技术,可以生产部分仪器。但是95%的市场都掌握在两家国外生产二代测序仪的公司手里(Thermo Fisher和illumina),剩余5%的市场份额,由一些国外三代测序仪厂商和中国厂商瓜分。
基因产业链中游企业主要提供针对基因大数据的服务,例如:癌症基因检测、精准预防等,我国的基因公司,大多集中在产业链中游。基因产业链下游包含药企、医院、科研机构和个人消费者。
图5:基因测序产业链及知名企业
【基因产业技术分析】
综观基因测序技术的分类,目前市场上应用普遍的是二代测序技术,对比一代测序技术有着通量高、成本低等优点。三代测序仪虽解决了二代测序仪读长短的缺点,但通量低,准确度不高。
图6:常用的基因检测方法
图7:第一代到第三代基因测试技术对比
聚合酶酶链式反应(PCR)
PCR是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点,是能将微量的DNA大幅增加。
聚合酶酶链式反应(PCR)常用类型
实时荧光定量PCR(qPCR):在PCR体系中加入荧光基因,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法,利用荧光信号的变化实时监测PCR扩增反应中每一个循环产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。
图8:qPCR的应用
数字PCR(dPCR):数字PCR一般包括两部分内容,即PCR扩增和荧光信号分析;需要将样品稀释到单分子水平,并平均分配到几十至几万个单元中进行反应;在扩增结束后对每个反应单元的荧光信号进行采集;通过直接计数或泊松分布公式计算样品原始浓度或者含量。dPCR主要应用在拷贝数变异、微小RNA分析、原癌基因的等位基因突变、传染病领域:病原学诊断、抗病毒治疗监测、预后判断等。
第二代测序技术(NGS)
NGS是高通量测序又名下一代测序,边合成边测序即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA序列。NGS测序流程包括样本收集、基因提取、文库构建测序和数据分析 ,各环节的准确性对测序结果有重要影响,比对数据库的规模直接影响数据分析结果的准确性。
图9:有代表性的二代测序仪
第三代测序技术
包括Helicos Bioscience单分子测序技术 和Pacific Bioscience SMRTT技术等。优势在于可以直接测RNA序列、直接测甲基化的DNA序列、精度非常高,达到99.9999%、实现了DNA聚合酶内在自身的延续性、实现了DNA聚合酶内在自身的反应速度。
徐健博士介绍,首度基因主要运用的是二代测序仪。首度基因的“全基因”测序产品,也称“全外显子”测序,检测人类全部的基因蛋白编码区域以及它们的调控区域。首度基因自主开发的FD-Exome全方位遗传检测,已经完全覆盖现在市场上几乎所有面向遗传的基因检测项目,既能够针对已知基因变异进行详细解读,又能够针对未知变异进行实时跟踪,从而使人能够有针对性的进行健康管理。
【基因产业热门应用】
二代测序仪巨头Illumina曾做过市场分析,基因测序技术在肿瘤上的应用将达到60%以上、120亿美金的市场规模;婚前、孕前、产前及新生儿基因检测可达20亿美元,占比为10%;微生物组、农业基因组等生命科学基础研究可达50亿美元,占比25%;个人基因测序、移植分型等新兴应用可达10亿美元,占比5%。
图10:基因测序在肿瘤市场的应用
基因测序技术目前最大的应用市场是肿瘤市场。中国每年450万新增癌症病人,每年死亡人数大概300万,带癌生存大概2000万。据2015年3月市场调研机构的统计,美国有5%的癌症患者做基因检测,中国不到1%(根据较早数据)。未来肿瘤基因检测市场会很大,通过肿瘤基因检测,找到发病机理,找到用药之道。
目前癌症治疗最好的是靶向用药,而靶向用药必须做基因检测。靶向用药跟化疗对比,患者痛苦更小,效率更高,副作用小,提高了癌症患者的生活质量。但值得注意的是,靶向用药除了价格昂贵外(一年靶向药物治疗费用15-30万美金),也会存在癌细胞产生耐药性或基因突变的问题,同时,癌细胞变异往往存在数种变异同时存在的情况。
图11:基因测序在液态活检中的应用
目前最为热门的基因测序应用是液态活检技术,例如通过捕捉和检测肿瘤中癌细胞进入唾液、血液、尿液或脑脊液中的DNA突变分子,从而制定有针对性的治疗方案。首度基因徐健博士举例:中国脑瘤确诊病人每年十万左右,死亡人数六至七万,脑瘤80%是由中枢神经淋巴瘤和胶质母细胞瘤两种亚型组成(二者的比例是1:2),脑瘤运用影像学观测困难,以前必须做穿刺或活检,当脑瘤位置比较深时,穿刺也会困难,只能开颅做活检,而对于中枢神经淋巴瘤较为有效的治疗方案是放疗,无需开颅,胶质母细胞瘤的有效方案则是开颅切除。脑脊髓液中有脑瘤细胞败坏以后释放出来的单细胞。通过脑脊髓液做液态活检,不穿刺或开颅就能检测出脑瘤的性质,这会为脑瘤患者做出巨大贡献,如果再找到针对性的靶点药物,临床意义将非常大。液态活检大大减轻了患者活检的痛苦,不过目前除了产前检测,大多数液态活检技术还停留在实验室阶段。
图12:基因测序在无创产前检测中的应用
基因测序技术最成熟的应用是在无创产前检测,中国是目前产前检测人数最多的国家,即便如此也只有20%的孕妇参与产前检测,虽然国内已形成4-5家企业垄断市场的局面,利润空间已挤压至很低,但仍存在非常巨大的市场空间。
图13:基因测序在疾病精准预防中的应用
徐健博士强调,基因测序技术运用在精准预防,比精准医疗对人类的贡献还要大。基因测序可以使疾病早期就被发现,大大提高患者生存率。例如家族性乳腺癌,在美国死亡率降低了80%,就是得益于精准预防。其实中国的肿瘤发病率占世界的22%,并不比发达国家高,但是死亡率却占到世界死亡率27%,原因之一是精准预防的普及不够,之二是审批通过的癌症治疗靶向药物数量远低于发达国家。作为精准预防的关键——基因测序技术,未来市场空间将是巨大的。
延伸阅读:
《新一代基因测序市场与技术分析》
《诊断应用的微流控技术专利分析-2017版》
《即时诊断市场-2016版》
《微流控市场-2016版》
《生物芯片市场-2016版》
《2016-2020年全球医疗保健应用的微流控市场》
《即时需求诊断:微流控技术应用》
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